Gaten Matarazzo có một chị gái và một em trai. Anh mắc chứng bệnh cleidocranial dysostosis, một đặc điểm mà anh đã chia sẻ qua vai diễn trong bộ phim Stranger Things của mình. Matarazzo sử dụng bộ răng giả như là một hậu quả cho căn bệnh của mình, và anh ấy cũng sử dụng sự nổi tiếng của hình để nâng cao nhận thức cho mọi người về vấn đề về căn bệnh này. Matarazoo đang trải qua một cuộc phẫu thuật miệng, bắt đầu từ tháng 10 năm 2017 để cải thiện nụ cười của mình.